Windows Server 2008 スタートアップ修復について

Windows Server 2008 が唐突にフリーズしてしまいました。

再起動しwindowsを通常起動してもデスクトップ画面表示後
2～3秒再びフリーズしてしまいます。

対応策としてインストールディスクからスタートアップ修復を実施しようとしているのですが、

例えばServerに保存されているデータやアプリケーション等が消えてしまう等、作業を行う上で何か把握しておく注意事項はありますでしょうか。

ご教示よろしくお願いいたします。

なお、作業手順は以下のページを参照しております。

http://www.lifeboat.jp/blog2/?p=922