スタートアップが起動しない事がある。

環境

Windows Server 2008 R2 Enterprise

CPU  2GHZ (8プロセッサ)

メモリ　32GB

64ビットOS

シンクライアントシステム、ターミナルサーバ、RDP接続

上記の環境でスタートアップにアプリを登録。

PCを起動してRDPでログインする。

スタートアップに登録したアプリが起動する事もあるが、三回に一回くらい起動しない事がある。

原因がわかりません。

何かヒントになる事でも良いので、情報をお願いいたします。